目前转基因生物中发展最为广泛的是转基因农作物。世界转基因农作物种植面积已由1995年时的120万公顷增加到1999年的3990万公顷。从1994年第一个转基因植物产品———延熟保鲜转基因番茄获得美国农业部和美国食品与药物管理局批准进入市场起，截至1998年6月，国外批准商业化应用的各类转基因植物已近90种。
1998年的统计资料表明，转基因农作物中以转基因大豆种植面积最大，达到1450万公顷，其次是转基因玉米、棉花、油菜和马铃薯。美国是转基因农作物商业化种植面积最大的国家。据估计，1999年美国转基因大豆、棉花和玉米的种植面积分别占相应作物总面积的55％、50％和30％。阿根廷和加拿大是继美国之后大量种植转基因农作物的国家。此外，转基因农作物种植面积较多的国家还有澳大利亚、墨西哥、西班牙、法国和南非等。
随着转基因农作物在全球迅速推广，转基因农作物产品市场销售额也逐年迅速增加，1995年转基因农作物的全球销售额仅为7500万美元。从目前的发展趋势预测，2000年全球转基因农作物产品的市场销售额可达30亿美元，到2010年可增至200亿美元。
有资料预计，美国的基因工程作物／食品产品的销售额将以每年16．3％的增长率增加，从1997年的40亿美元增长到2002年的85亿美元。当越来越多的转基因食品呈现在我们面前时，首当其冲的问题就是：转基因食品有副作用吗？科学家对转基因食品对人体是否有害目前仍不能确定。这也是目前转基因食品的支持者和反对者争论的关键所在。在此情况下，转基因技术（包括转基因食品）的安全性问题，很快引起人们的极大关注，世界上许多国家都制定了对转基因生物的管理法规和办法。我国也正在起草命名为《中国生物安全国家框架》的法规。
部分科学家认为，目前的科学水平还不能完全精确地预测一个外源基因在新的遗传背景中产生什么样的相互作用。但从理论上讲，转基因食品是安全的。因为它们上市之前是经过大量试验和许多部门严格检验的，而且转基因食品在体内不积累，不会产生副作用。总之，转基因食品的前景是乐观的。
部分科学家提出，由于造成病害的微生物或害虫不断进行演化，而且农作物的种植环境气候也不断变化，受影响的农作物必须改良才能应付新的环境，转基因技术于是成为保障人类未来粮食供应的重要工具。
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